Le Cartel est une organisation secrète, que l'on retrouve à tous les niveaux du gouvernement américain (économique, politique, judiciaire ou encore militaire
L'organisation a fait tuer des milliers de gens pour garder leur couverture secrète.
Le Cartel est dirigé par le Général Krantz. Le père de Michael Scofield et de Lincoln Burrows faisait parti de l'organisation et aurait été un de leur tueurs à gages selon le Général Krantz. La mère des deux frères, que l'on croit morte de la saison 1 à 3, travaille secrètement pour le cartel depuis sa "mort".